Ежевика входит в род Rubus L., подрод Eubatus Focke (= Rubus Watson), насчитывающий в мировой флоре, по свидетельству разных авторов, от 132 до 200 видов и более и имеющий значительное количество межвидовых форм. В рамках данного подрода широко распространена естественная полиплоидность, представленная полиплоидным рядом форм, имеющих наборы хромосом от 2x (2n = 14) до 12x (2n = 84) с основным числом х = 7, включая анеуплоиды (имеющие несбалансированные наборы хромосом) разного уровня плоидности. У культивируемых сортов полиплоидные ряды тоже имеют место, с преобладанием тетраплоидов. Родоначальниками большинства сортов подрода Eubatus стали дикорастущие виды Северной Америки и Европы. Наиболее значимыми при создании сортов ежевики оказались такие североамериканские виды, как: R. allegheniensis Porter, R. argutus Link. и R. canadensis L. (давшие начало первым пряморослым и наиболее зимостойким сортам – Agawam, Lawton, Snyder, Erie и др.), R. ursinus Cham. & Schlecht., R. macropetalus Dougl. и R. loganobaccus Bailey (важнейшие виды, от которых получены лучшие стелющиеся сорта ежевики и малино-ежевичные гибриды Logan, Young, Boysen и др.), R. laciniatus Willd. (от его бесшипной химеры получен известный сорт Thornless Evergreen), R. trivialis L. (одна из родительских форм пряморослого засухоустойчивого сорта Brazos, активно использовавшегося при создании современных сортов), R. ulmifolius Schott. (от него получен тетраплоидный источник рецессивного гена бесшипности – сорт Merton Thornless) и др. Видовую принадлежность современных сортов определить, как правило, невозможно или очень сложно, так как в их геномах часто присутствует геноплазма нескольких видов и их гибридных потомков, а также различных по происхождению сортов, что, в свою очередь, усложняется полиплоидностью и связанной с ней гетерозиготностью культуры.
В России наибольшее количество дикорастущих видов ежевики (около 40) распространено на Кавказе. В условиях средней полосы нашей страны преобладают всего два вида – R. caesius L. со стелющимися побегами и R. nessensis W. Hall с пряморослыми побегами.