Как и в остальной Европе, в Швейцарии в Средние века господствовала феодальная система. С IV века на эту территорию начало проникать христианство, а в VII веке его влияние значительно усилилось благодаря странствующим монахам из Ирландии. Один из них, Святой Галл или Галлус из Лейнстера (по некоторым версиям, его имя было Келлах), поселился в восточной Швейцарии и в 613 году основал монастырь Санкт-Галлен (Святого Галла). Позднее вокруг монастыря вырос город Санкт-Галлен, центр одноименного кантона, а сам монастырский комплекс в 1983 году был внесен в список объектов Всемирного наследия ЮНЕСКО как «совершенный образец большого монастыря эпохи Каролингов».
В IV–VIII веках Швейцария, как и ее соседи, была разделена на небольшие королевства. Когда королем франков стал Карл Великий (в 768 году), в Западной Европе образовалась мощная империя. Карлом (или Шарлеманем, как его называют французы) Швейцария была разделена на десять графств.
В 843 году Верденский договор о разделе империи Карла Великого поделил Швейцарию на части: западная часть вместе с Бургундией и южная часть вместе с Италией отошли к императору Лотарю I, а восточная часть со всей Алеманнией – к королю Людвигу Немецкому. В этой части Швейцарии видную роль начал играть город Цюрих.
Затем Людвиг Немецкий расширил владения и права ранее существовавшего монастыря Санкт-Галлен, который в следующие века был важным центром просвещения в Швейцарии.
Распадение монархии Карла Великого ослабило ее; короли не всегда могли защищать свои владения от набегов полудиких варваров. В Х веке Швейцарии стали угрожать с востока венгры, с юга – сарацины. В 917 году первые разграбили Базель, в 926 году – Санкт-Галлен; в 936–940 годах сарацины опустошили Хурретию (Граубюнден), сожгли в Валлисе монастырь Святого Маврикия и ограбили Ваадт.
В 911 году образовалось герцогство Алеманния, и восточная Швейцария вошла в его состав.
В 1032 году, во время правления императора Конрада II, Бургундия стала частью Священной Римской империи, и в течение трех столетий после этого судьба Швейцарии находилась в зависимости от германских императоров. Только Тессин, или Тичино, да небольшая часть Граубюндена, тесно связанные с Миланом, зависели от императоров лишь постольку, поскольку они одновременно были еще и итальянскими королями.
С увеличением могущества отдельных феодальных правителей, старые Алеманния и Бургундия распались на множество отдельных владений. А на территории нынешней Швейцарии в конце XI и начале XII веков, наряду со многими другими графскими и герцогскими родами, особенно возвысились графы (с конца XI века – герцоги) Церингены. Они сначала владели графством Тургау, но постепенно получили еще и различные владения от Женевского озера до Ааре. Кроме того, они имели право наследственного фогтства в Цюрихгау (в той его части, которая не зависела от Цюрихского монастыря), а в 1127 году получили звание наместников Бургундии.
Получается, что централизация власти на территории, которую мы теперь называем Швейцарией, была слабой, и местные князья, особенно Церингены и Кибурги, а позже династия Габсбургов, обладали большим влиянием.
Светские владетели Швейцарии, в особенности Церингены, в видах борьбы с весьма сильными уже монастырями, поощряли развитие городов и основали целый ряд новых: Фрайбург (1178), Берн (в конце XII века), Тун, Муртен и др. (в XIII веке).
Рядом с Церингенами приобрели большие владения в течение XIII века графы Габсбурги, Кибурги, Савойские. В 1218 году угас род герцогов Церингенов; часть их владений сделались имперскими, часть перешла в другие руки. При дележе наследства особенно посчастливилось графам Кибургам и графам Габсбургам, а последние в 1264 году наследовали и угасшему роду Кибургов. Фогтство над Цюрихгау перешло к императору, который сделал город Цюрих имперским, а другие части области разделил на несколько мелких фогтств.