Сегмент государственных закупок включает в себя закупки лекарственных препаратов для медицинских организаций (госпитальный сектор), для льготного лекарственного обеспечения населения и для нужд федеральных министерств и ведомств. Источником его финансирования служат средства бюджетов всех уровней и обязательного медицинского страхования. С 2005 г. государственные закупки ЛП осуществлялись в основном в соответствии с Федеральным законом № 94 «О размещении заказов на поставки товаров, выполнение работ, оказание услуг для государственных и муниципальных нужд» от 21.07.2005 г. В январе 2012 г. вступил в силу Федеральный закон № 223 от 18.07.2011 г. «О закупках товаров, работ, услуг отдельными видами юридических лиц». Он позволяет закупать лекарственные препараты по торговому наименованию, а не только по МНН, а также у единственного поставщика. Это делает закупку уязвимой для лоббистов конкретного бренда. Процессы госзакупок для здравоохранения традиционно подвергаются критике на предмет их коррумпированности, поэтому регулярно меняются их правила. С начала 2014 г. на смену 94-ФЗ пришел 44-ФЗ «О контрактной системе в сфере закупок товаров, работ, услуг для обеспечения государственных и муниципальных нужд». Закупки в соответствии с этим законом осуществляются по МНН за исключением ЛС из перечня, определяемого правительством РФ. Это снижает риск коррупции. 1 января 2014 г. вступило в силу постановление Правительства РФ № 929 «Об установлении предельного значения начальной (максимальной) цены контракта (лота) при превышении которого не могут быть предметом одного контракта (одного лота) лекарственные средства с различными международными непатентованными наименованиями или при отсутствии таких наименований с химическими, группировочными наименованиями», направленное на разукрупнение лотов.
С целью поддержки отечественного фармпроизводителя и в качестве ответного шага на введение западных санкций против России, 30 ноября 2015 г. вышло постановление Правительства РФ № 1289 «Об установлении ограничений допуска иностранных лекарственных препаратов при государственных закупках», получившее прозвище «третий лишний». Оно ограничило допуск к участию в госзакупках лекарств, произведенных за пределами Таможенного союза, если у них есть не менее двух аналогов российского (или стран ТС) производства.