Описание теории кодофлексии посредством категорий является предельно обобщённым. Предельная обобщённость, с одной стороны, приводит к созданию дескрипции39, приближающейся к истинной, с другой стороны, не способствует подробному объяснению прошлых и настоящего состояний реальности и обстоятельной антиципации40 будущего. Недостатки предельной обобщённости преодолеваются при переходе от категориального подхода к системному, углубляющему и расширяющему дескрипцию.
Системный подход к исследованиям создавался и развивается в общей теории систем, холизме, системном анализе и других областях науки о целостности познания. Методология целостности получает своё развитие в научной области с названием «системнология41». Переход от категориально-ординарного мышления к системно-ординарному сопровождается эквивалентной заменой категорий системнологическими понятиями.
Основное категориальное понятие – реальность. Человеческому сознанию доступна лишь её часть, которая предстаёт познанной и познаваемой, т.е. изучаемой или исследуемой, реальностью. Способностью к познанию обладает антропная42 составляющая.
Основное системнологическое понятие, углубляющее и расширяющее категорию познаваемой реальности – это понятие системы, раскрываемое на основе положений теории кодофлексии.
Система в системнологии – осознаваемое при кодофлексии отображение обособленной в соответствии с целью части познаваемой реальности, разделяющееся на компоненты, которые посредством отношений соединяются в целое, связанное с внешней средой.
Часть познаваемой реальности обособляется в соответствии её целью, которая относительно системы становится назначением, т.е. функцией, системы.
Определение понятия системы охватывает подчинённые понятия компонента, отношений и внешней среды.
В соответствии с положением о сопринадлежности система может быть исходной, которая содержит компоненты, и последующей, содержащей компоненты или элементы.
Компонент43 отображает осознаваемые при кодофлексии формообразования, является составной частью системы, обособляемой в соответствии её функцией, и предстаёт последующей системой, которая разделяется на следующие компоненты, соединяемые в целое отношениями.
Компонент, не разделяемый на последующие компоненты, является элементом системы.
Отношения в системе отображают собой осознаваемые при кодофлексии взаимовлияния формообразований познаваемой реальности и предстают межкомпонентными связями.
Внешняя среда системы отображает осознаваемое при кодофлексии внешнее окружение познаваемой реальности, является особым компонентом и предстаёт последующей системой, которая разделяется на следующие компоненты, находящиеся в отношениях с компонентами исходной системы.
Содержание компонентов и отношений в системе отображает осознаваемую при кодофлексии субстанцию формообразований познаваемой реальности и их взаимовлияния.
Содержание абиотических компонентов и отношений в абиотической системе отображает осознаваемую при кодофлексии субстанцию косных формообразований и их взаимовлияния. Содержание биотических компонентов в системе отображает осознаваемую при кодофлексии субстанцию живых формообразований. Разница содержания биотического и абиотического компонентов обусловливается разницей между живой и косной субстанцией.
Транскодированное44 представление компонентов и отношений системы внутри биотического компонента, т.е. биотранскодинг, отображает осознаваемую при кодофлексии имитацию познаваемой реальности.
Соответствие категорий и основных системнологических понятий представлено в табл.1.
Таблица 1. Категории и системнологические понятия
Основные системнологические понятия дополняются следующими понятиями и терминами45.
Отношения в системе между компонентами в данный момент времени являются связями взаимодействия. Описание взаимодействия нуждается в фиксации46 положения компонентов относительно друг друга, т.е. в применении пространственных координат47.
Отношения, определяющие неизменность состояния и свойств компонентов во времени, представляют собой связи наследования. Описание наследования нуждается в фиксации предыдущих и последующих состояний компонента в согласованный момент, т.е. в применении временных показателей.
Принцип УНЭВ позволяет утверждать, что неизменность состояния и свойств компонента поддерживается изменчивостью компонентов, с которыми он находится во взаимодействии, и его внутренней изменчивостью. В силу данного обстоятельства наследование вполне резонно заместить процессами.
Изменение состояния и свойств компонента во времени, а также изменение взаимодействия компонентов именуется процессом, который может быть консервативным48 или неконсервативным. Консервативные процессы поддерживают постоянство компонентов и их взаимодействия, а неконсервативные – изменчивость. В общесистемный процесс вовлекаются все компоненты системы, а в парциальный – часть их. Процесс в системе начинается, переходит из одной стадии в другую и завершается событием.
Отношения в системе по обусловленности её функцией разделяются на предопределённые, или детерминированные49, и предполагаемые, т.е. стохастические50.
Изменения внутри компонентов, вызываемые неконсервативными процессами взаимодействия, предстают результатами, которые называются эффектами взаимодействия.
Взаимодействие с уровнем, при небольшом отклонении от которого внутри компонента возникают эффекты, приводящие к неисполнению им своей функции, является критическим51 взаимодействием.
Системнология обусловливает специфические приёмы системнологического метода, в том числе системацию, декомпозицию, структурацию52 и др. Системация предусматривает формирование системы и определение её функции. При декомпозиции определяется компонентный состав. Посредством структурации определяется структура системы, предстающая совокупностью компонентов и детерминированных отношений.
Содержание компонентов и отношений далее раскрывается с применением системнологического метода.
Системация как приём системнологического метода позволяет раскрыть цель обособляемой части познаваемой реальности, заместить её системой с указанием наименования и функции.
Цель эволюции реальности в соответствии с принципами УНЭВ и телеономичности заключается в достижении эквифинального состояния с полным воспроизведением (имитацией) существующего. Составляющими реальности являются сингулярная, косная и живая.
Цель эволюции косной составляющей реальности заключается в достижении состояния, необходимого и достаточного для возникновения живой составляющей, а также для сопровождения её эволюционного усложнения.
Осознаваемое при кодофлексии отображение обособленной в соответствии с целью косной составляющей реальности, разделяющееся на компоненты, которые посредством отношений соединяются в целое, связанное с внешней средой, предстаёт абиотической системой. Функция абиотической системы состоит в поддержании состояния, необходимого и достаточного для возникновения живой составляющей, а также для сопровождения её эволюционного усложнения.
Абиотическая система исходной ступени сопринадлежности отображает осознаваемую при кодофлексии косную составляющую реальности и её формообразования. Разделение системы на компоненты позволяет обособить абиотические компоненты первого уровня декомпозиции и внешнюю среду. Абиотическая система первого уровня, бывшая компонентом первого уровня, декомпозируется на компоненты второго уровня и т.д. Система переходного уровня декомпозиции отображает переход от формообразования к субстанции, его наполняющей. Абиотические компоненты переходного и низших уровней, отображающие косную субстанцию, обладают определённым содержанием. Для его именования используются общепринятые названия – вещество и энергия. Абиотический компонент наполнен содержимым из двух слагаемых, называемых веществом и энергией.
В системнологии отображающее субстанцию осознаваемое при кодофлексии слагаемое компонента, которое проявляется массой, предстаёт его структурой и служит носителем энергии, представляет собой вещество. А отображающее субстанцию осознаваемое при кодофлексии слагаемое компонента, которое проявляется посредством силы, поддерживает его структуру, придаёт ему активность и может создавать поле, предстаёт энергией.
Абиотические компоненты, процессы и взаимодействия в абиотической системе, имея вещественно-энергетическое содержание, описываются свойствами вещества и энергии.
Цель эволюции живой составляющей реальности заключается в достижении состояния с полным воспроизведением (имитацией) существующего.
Осознаваемое при кодофлексии отображение обособленной в соответствии с целью живой составляющей реальности, разделяющееся на компоненты, которые посредством отношений соединяются в целое, связанное с внешней средой, предстаёт биотической системой.
Функция биотической системы состоит в поддержании состояния, необходимого и достаточного для воспроизведения (имитации) существующего, а также для эволюционного усложнения имплеонизмов53 воспроизведения (имитации).
Биотическая система исходного уровня сопринадлежности отображает осознаваемую при кодофлексии живую составляющую реальности и её формообразования. Разделение системы на компоненты позволяет обособить биотические компоненты первого уровня декомпозиции и внешнюю среду. Биотическая система первого уровня, бывшая компонентом первого уровня, декомпозируется на компоненты второго уровня и т.д. Низшая организованность живой составляющей реальности отображается переходной биотической системой. Компоненты этой системы и высших уровней сопринадлежности, отображая живое, имеют определённое содержание. Биотический компонент наполнен содержимым из трёх слагаемых: вещества, энергии, сциенции. Слово «сциенция» вводится системнологией и является неологизмом54, происходящим от латинского scio – знать, уметь, понимать, ведать.
Биотический компонент в сравнении с абиотическим компонентом содержит более сложное вещество и энергию, соответствующую сложности вещества.
Более сложные вещество и энергия имеют дополнительные свойства, обусловливающие транскодированное представление компонентов и отношений системы внутри биотического компонента, т.е. биотранскодинг, посредством знаков, создаваемых этими веществом и энергией.
Совокупность биотических транскодируемых вещественно-энергетических знаков, знаков биотранскодинга, предстаёт сциенцией.
Биотическая система приобретает способность к биотранскодингу посредством сциенции. Сциенция придаёт биотическим компонентам и системе состояние простейшего организма, органа или сложного организма.
Понятие сциенции имеет следующую семантему55. Отображающее живую субстанцию осознаваемое при кодофлексии слагаемое биотического компонента, которое придаёт ему организованность посредством биотранскодинга и проявляется аутоактантными совокупностями вещественно-энергетических знаков при их восприятии, преобразовании, создании, передаче, хранении, воспроизведении, применении в поведении, именуется в системнологии сциенцией.
Компоненты биотических систем переходной и высших уровней сопринадлежности обладают вещественным, энергетическим и сциентным содержанием. Компоненты систем низших относительно переходной уровней сопринадлежности остаются вещественно-энергетическими.
Единицей биотранскодинга (транскодированного представления компонентов и отношений системы внутри биотического компонента) является сциентный знак. Сциенция предстаёт не произвольным набором транскодируемых вещественно-энергетических знаков, а их взаимодополняющей совокупностью, обладающей комплексом физико-химических свойств.
Новое понятие сциенции заменяет собой часто используемое в научной литературе понятие биологической информации: «Все клетки человеческого тела несут полную копию генома нашего вида в своих ядрах, представляющую собой двухцепочечную молекулу ДНК, скрученную в хорошо известную каждому двойную спираль. Информация, закодированная в геноме при помощи генетического кода, экспрессируется в белки, которые и выполняют большинство функций в клетке. В каждом ядре ДНК транскрибируется в матричную РНК, которая затем транслируется в белки. Гены и молекулы играют разные роли на разных стадиях развития: они направляют эволюцию мозга, включая язык, социальные взаимоотношения и способность распознавать выражения лиц. Они контролируют развитие мозга в течение всей жизни – от роста мозга плода и до его старения» [5].
Макромолекулы белков и нуклеиновых кислот представляют собой полимеры, образованные из мономеров. Полимеры характеризуются не только количеством атомов и конфигурацией, но конформационной многовариантностью. Сциенция полимера предстаёт вещественно-энергетическими знаками биотранскодинга, создаваемыми, например, при размещении на условной огибающей поверхности макромолекулы с выступами, впадинами, складками и другими топологическими особенностями её рельефа определённого количества возможных точек водородного, ван-дер-ваальсового, электростатического и иного перманентного56 взаимодействия.
Обнаруживаемая на примере полимеров способность вещественно-энергетических знаков транскодинга, вызывать преобразование энергии и химическое взаимодействие биомолекул обусловливает самодействие, или аутоактантность57, сциенции.
Сциенция выражается не только совокупностями вещественно-энергетических знаков транскодинга, но и самодействием, т.е. аутоактантностью, этих знаков. Аутоактантность транскодируемых знаков возникает при изменениях межкомпонентного взаимодействия и обеспечивается свойствами вещества и энергии, посредством которых эти знаки создаются.
Примером описания аутоактантности может быть следующее: «В белках тоже есть локальные электрические заряды, часто расположенные в труднодоступных участках внутри белка или на его выпуклых частях. Распределение зарядов и форма белка продиктованы последовательностью аминокислот. Иногда молекула белка, вогнутая спереди и выпуклая сзади, так что выпуклость одного белка совпадает с вогнутой частью другого, как детали конструктора Lego. В этом случае молекулы белка могут выстроиться «голова к хвосту» в тонкую структуру сколь угодно большой длины. Чаще, однако, белок может распознавать участки связывания не только в других белках или каких-либо других молекулах, но и в собственной структуре. Это означает, что он не может создавать бесконечные нити с идентичными молекулами, как это происходит в кристаллах, а связывается только с определенным количеством белков, образуя многокомпонентные комплексы особой структуры» [6].
Вещественно-энергетические знаки сциенции являются не только транскодируемыми, но и исполняющими самодействие, т.е. аутоактантными. Как следствие, сциенция подразделяется на энграммную58 и куррентную59.
Энграммная, или «записанная», сциенция, являющаяся транскодируемой, и куррентная, или «текущая», исполняющая энграммную, предстают сциенцией биотического компонента.
Сциенции при выражении её только совокупностью знаков вырождается в понятие «информация60». Для информации неважны и незначимы вещественно-энергетическое содержание этих знаков и их аутоактантность. Этим объясняется необходимость введения более совершенного понятия «сциенция».
Сциентные свойства предстают свойствами организмов, начиная со свойств протоорганизмов (органоидов), вирусов, продолжая одноклеточными прокариотными и эукариотными микроорганизмами, многоклеточными макроорганизмами, заканчивая социальными квазиорганизмами, например, семьёй.
Сциенция как совокупность биотических транскодируемых вещественно-энергетических знаков компонента биотической системы является синергетической, использующей на каждой последующей стадии эволюции сциенцию предшествующих систем и биотических компонентов.
Высший тип61 антропной сциенции, определяющий поведение и деятельность человека, называется знанием, существующем в практическом, прикладном и теоретическом видах.
Сциенция как совокупность биотических транскодируемых вещественно-энергетических знаков, знаков биотранскодинга, способствует организованности биотических компонентов и систем на всех уровнях сопринадлежности от протоорганоидов до макроорганизмов.
Абиотические компоненты с вещественно-энергетическим содержанием описываются свойствами вещества и энергии. Эволюция косной субстанции отображается осознаваемой при кодофлексии эволюцией вещественно-энергетических свойств. Вещественные свойства эволюционируют от свойств амеров до свойств макромолекулярных частиц. Энергетические свойства эволюционируют вместе с эволюцией вещественных свойств. При образовании макромолекулярных частиц возникают дополнительные свойства, называемые сциентными.
Биотические компоненты со сциентным содержанием описываются свойствами сциенции. Эволюция живой субстанции отображается осознаваемой при кодофлексии эволюцией сциентных свойств. Сциентные свойства – это свойства организмов, начиная с протоорганоидов, продолжая внутриклеточными органоидами, клетками, органами многоклеточных организмов, многоклеточными и социальными организмами.
Свойства сциенции обеспечиваются теми веществом и энергией, посредством которых она создаётся. Вещественные свойства сциенции определяются типом вещественных знаков, а энергетические – видами энергетических знаков. Доминирование в сциенции вещественных или энергетических свойств обусловливает её вещественно-энергетическую или энерго-вещественную разновидность.
Знаком, определяющим энергетические свойства сциенции, служит нескомпенсированный, частично или временно скомпенсированный электрический заряд. Электрический заряд определяет способность частиц быть источниками электромагнитных полей и принимать участие в электромагнитном взаимодействии.
К знакам, определяющим вещественные свойства сциенции и, как следствие, её аутоактантность, относятся биотические частицы – носители нескомпенсированных, частично или временно скомпенсированных электрических зарядов.
Первичным носителем заряда является электрон62 с определёнными массой и спином. Электрон – стабильная отрицательно заряженная частица, которая не разделяется на компоненты и служит одним из основных структурных компонентов вещества.
К носителям зарядов относятся также ионы63. Ион образуется из атома или молекулы при потере или присоединении одного или нескольких электронов. Ион, имеющий положительный заряд, называется катионом, отрицательный – анионом.
Отрицательно заряженные ионы образуются в результате присоединения к атому или молекуле электронов. Присоединение электрона сопровождается выделением энергии.
Атомные и молекулярные частицы превращаются в положительно заряженные ионы при потере одного или нескольких электронов. Отрыв электрона от атома или молекулы требует затрат энергии. При низких значениях энергии ионизации частицы легко теряют свои внешние электроны под действием электромагнитной энергии. Отрыв электрона происходит вследствие поглощения частицей фотонов электромагнитной энергии.
Фотон электромагнитной энергии – электрически нейтральный квант электромагнитного поля, движущийся со скоростью света и электромагнитно взаимодействующий с частицами вещества.
Поглощение фотонов частицами вещества сопровождается переходом электрона с менее высокого энергетического уровня на более высокий и его освобождением, которое именуется фотоэффектом. Фотоэлектрический эффект представляет собой освобождение из частиц электронов вследствие поглощения фотонов, создающих нескомпенсированные электрические заряды.
Возврат электрона с более высокого энергетического уровня на менее высокий сопровождается излучением фотонов или безизлучательным переносом энергии с её поглощением и переходом частицы в более активное кинетическое состояние.
К биотическим носителям нескомпенсированных, частично или временно скомпенсированных электрических зарядов, определяющим вещественные свойства сциенции, относятся макромолекулярные частицы.
Макромолекулярная частица становится носителем нескомпенсированных электрических зарядов после разрыва её водородного, ван-дер-ваальсового, электростатического или иного слабого взаимодействия с другими частицами, например с частицами ассоциированной воды. Разрыв коннексии64 взаимодействия сопровождается поглощением электромагнитной или кинетической энергии.
Сциенция предстаёт совокупностью энергетических и вещественных знаков, участвующих в биотранскодинге.
Сопринадлежность протоорганоида65 заключается в том, что в его состав входят квазиорганоиды, которые состоят из антеорганоидов66. Протоорганоиды в отличие от квазиорганоидов обладают аутоактантностью.
Квазиорганоиды представляют собой супрамолекулярные соединения антеорганоидов. Антеорганоиды являются органическими полимерами, содержащими кроме углерода, водород, азот, кислород, серу, фосфор и другие химические элементы.
Органические полимеры состоят из повторяющихся звеньев, т.е. органических мономеров, в которых реализуются катенационная и асимметрическая специфичности углерода.
Взаимодействие в органических мономерах представляет собой перманентное взаимодействие, определяемое коннексией частиц, состоящих из атомов, и частиц, входящих в состав атомов. Основной разновидностью внутримолекулярной коннексии мономеров служит перманентное ковалентное67 взаимодействие.
Органические мономеры предстают субмолекулярными частицами, образованными атомами, в том числе асимметрическим атомом углерода. Асимметрический атом углерода ковалентно коннексирован с четырьмя разными радикалами, обусловливая хиральность68 частицы.
Органические мономеры с одним асимметрическим атомом углерода существуют в виде двух изомеров69, соотносящихся между собой как предмет и его зеркальное отражение. Изомеры по-разному отклоняют фотоны поляризованной электромагнитной энергии, проходящие через их растворы, и в соответствии с направлением этого отклонения называются правовращающимися D70 и левовращающимися L71. Изомеры, называемые энантиомерами, похожи, но не тождественны друг другу. Энантиомеры имеют одинаковый состав, но разное относительное расположение субчастиц в пространстве, то есть разную хиральность.
Другая особенность мономеров заключается в том, что электроны межсубчастичных молекулярных орбиталей способны поглощать кванты электромагнитной энергии и переходить на более высокие энергетические уровни и затем высвобождаться. Возврат электронов в прежние состояния сопровождается излучением квантов электромагнитной энергии или переносом поглощённой энергии по мономеру и переходом мономера в активное кинетическое состояние.
Органические мономеры, состоящие из субмолекулярных частиц, имеют в своём составе ковалентно взаимодействующие атомы водорода, кислорода и азота. Ковалентно коннексирующий в субмолекулярной частице атом водорода с частичным или частично некомпенсированным положительным зарядом одного мономера способен вступать во взаимодействие с ковалентно коннексирующим в субмолекулярной частице атомом кислорода или азота с частичным или частично некомпенсированным отрицательным зарядом другой молекулы с образованием перманентного водородного взаимодействия. В свою очередь, ковалентно коннексирующий в субмолекулярной частице атом кислорода или атом азота с частичным отрицательным зарядом одного мономера способен взаимодействовать с ковалентно коннексирующим в субмолекулярной частице атомом водорода с частичным положительным зарядом другой молекулы также с образованием перманентного водородного взаимодействия. Энергия водородной коннексии имеет малые значения, но при большом количестве взаимодействий она становится определяющей. Нескомпенсированные и частично некомпенсированные заряды мономера могут компенсироваться коннексией с молекулами воды при малых затратах энергии.
Межмолекулярные взаимодействия с участием мономеров представляют собой энергетические взаимодействия. Они разделяются на универсальные и специфические. Универсальные межмолекулярные взаимодействия, называемые также ван-дер-ваальсовыми, совершаются между любыми молекулами. Они подразделяются на ориентационные, т.е. диполь-дипольные, индукционные, дисперсионные и отталкивательные коннексии взаимодействия. Специфические межмолекулярные взаимодействия относятся к индивидуальным, присущим данной паре коннексирующих частиц. Специфические коннексии предстают прерывными взаимодействиями в виде упругих и неупругих столкновений, перманентными и лабильными водородными связями взаимодействия, а также ионными коннексиями, обусловленными переносом валентных электронов с одного атома на другой с образованием электростатически взаимодействующих положительных и отрицательных ионов.
Полимеры в отличие от мономеров характеризуются не только количеством атомов, хиральностью и конфигурацией, но конформационной72 и структурной многовариантностью.
Конформация полимера представляет собой пространственную форму, которая возникает при повороте её отдельных частей относительно друг друга вокруг устойчивых коннексий между ними. При переходе от одной конформации к другой расходуется энергия, конфигурация полимера при этом не меняется. Полимер может иметь много конформаций, но устойчивыми из них являются те, которые обеспечиваются минимальными количествами энергии.
Полимеры состоят из мономеров, имеющих в своём составе ковалентно коннексированные атомы водорода, кислорода, азота с частично некомпенсированным зарядом, которые способны взаимодействовать с ковалентно коннексированными в другом мономере атомами с образованием перманентного водородного взаимодействия.
Частичные заряды вне полимерных коннексий компенсируются при малых значениях энергии связями перманентного взаимодействия с молекулами воды.
Многоатомный состав, хиральность, конфигурация и конформация приводят к образованию перманентных, в основном водородных связей взаимодействия между повторяющимися и разными мономерами полимера, придавая его структуре пекулиарность73.
Полимер имеет конституцию74 и конфигурацию, находится в определённом конформационном состоянии и предстаёт пекулиарной структурой, обусловленной конституцией, конфигурацией, конформацией и взаимодействием с компонентами внешнего окружения, в частности взаимодействием с молекулами воды.
Конституция полимера представляет собой тип, количество, хиральность и связность атомов в нём. Связность предстаёт длинами связи и углами между смежными коннексиями.
Конфигурация есть расположение в пространстве атомов полимера заданной конституции без учёта всех иных расположений, получаемых из данного только вращением вокруг одной или нескольких простых связей.
Данная конституция полимера и его конкретная конфигурация не позволяют чётко зафиксировать положение атомов в пространстве, поскольку оно обусловливается также их вращением вокруг одной или нескольких простых связей взаимодействия. Под конформацией полимера данной конституции и конкретной конфигурации понимают расположение атомов вокруг всех коннексий, которое задаётся указанием величин и знаков всех торсионных75 углов. Торсионный угол есть угол между двумя коннексиями, расположенными в разных плоскостях.
Полимер предстаёт последовательностью соединённых ковалентными коннексиями мономеров-звеньев. Энергетическая особенность полимера заключается в том, что электроны межсубчастичных молекулярных орбиталей мономеров и электроны межзвенных молекулярных орбиталей способны поглощать кванты электромагнитной энергии и переходить на более высокие орбиты и затем высвобождаться. Возврат электронов в прежние состояния сопровождается излучением и/или переносом энергии по макромолекуле с поглощением и переходом полимера в активное кинетическое состояние.
Излучаемая электромагнитная энергия воспринимается электронами межсубчастичных молекулярных орбиталей мономеров и электронами межзвенных молекулярных орбиталей. Поглощённая энергия распространяется по макромолекуле и способствует образованию дополнительных, в основном водородных связей взаимодействия между мономерами одного полимера.
Антеорганоиды как органические полимеры предстают, прежде всего, пептидными76 и нуклеиновыми77 полимерами, которые являются носителями антесциенции.
Антесциенция полимеров представляет собой совокупности вещественно-энергетических знаков, которые при вхождении антеорганоидов в состав органоидов, способны участвовать в биотранскодинге.
В состав антесциенции входят следующие вещественно-энергетические знаки:
– нескомпенсированные, частично нескомпенсированные и временно скомпенсированные электрические заряды, их потенциальные, потоковые и полевые характеристики;
– конституция, в том числе хиральная, конфигурация, конформация носителей нескомпенсированных, частично нескомпенсированных и временно скомпенсированных электрических зарядов с их потенциальными, потоковыми и полевыми характеристикам;
– пекулиарная структура, обусловленная конституцией, в том числе хиральной, конфигурацией, конформацией носителей нескомпенсированных, частично нескомпенсированных и временно скомпенсированных электрических зарядов с их потенциальными, потоковыми и полевыми характеристикам и пространственным распределением.
Квазиорганоиды предстают супрамолекулярными78 соединениями антеорганоидов и других органических молекул, прежде всего, белков, нуклеиновых кислот, углеводов, липидов. В частности, к белковым супрамолекулярным соединениям относятся нуклеопротеины, липид-белковые комплексы и липопротеины, углевод-белковые комплексы, хромопротеины, фосфопротеины и др.
Супрамолекулярные соединения предстают системами, в которых её компоненты взаимодействуют друг с другом, при этом процесс взаимодействия допускает их относительное перемещение в пространстве.
Внешняя среда супрамолекулярной системы может находиться в следующих фазовых79 состояниях, или фазах: в газовой, жидкой, газовой и жидкой, газовой и твёрдой, жидкой и твёрдой.
Энергия межкомпонентного взаимодействия в супрамолекулярной системе коннексирует молекулы в целое, связанное с внешней средой и имеющее какую-либо стереоформацию80.
Межкомпонентное взаимодействие в супрамолекулярной системе является перманентным нековалентным межмолекулярным взаимодействием, которое имеет следующие разновидности: ван-дер-ваальсовое, водородное, электростатическое, ароматическое (стэкинг-взаимодействие), лиофильное81, лиофобное82.
Во всех супрамолекулярных системах коннексирующий компонент содержит места, или локусы83, коннексии, посредством которых происходит селективное84 связывание коннексируемого компонента, в том числе по образу «замочная скважина – ключ от замка».
Супрамолекулярные системы имеют несколько стереоформационных состояний с переходами между ними, имеющими низкие энергетические барьеры. Изменение стереосостояния супрамолекулярной системы вследствие изменений во внешней среде сопровождается изменением её вещественно-энергетических свойств.
Квазисциенция супрамолекулярных соединений представляет собой совокупности вещественно-энергетических знаков, которые при вхождении квазиорганоидов в состав органоидов, способны участвовать в биотранскодинге.
В состав квазисциенции входят следующие вещественно-энергетические знаки супрамолекулярных соединений:
– нескомпенсированные, частично нескомпенсированные и временно скомпенсированные электрические заряды, их потенциальные, потоковые и полевые характеристики;
– конституция, в том числе хиральная, конфигурация, конформация носителей нескомпенсированных, частично нескомпенсированных и временно скомпенсированных электрических зарядов с их потенциальными, потоковыми и полевыми характеристикам;
– пекулиарная структура, обусловленная конституцией, в том числе хиральной, конфигурацией, конформацией носителей нескомпенсированных, частично нескомпенсированных и временно скомпенсированных электрических зарядов с их потенциальными, потоковыми и полевыми характеристикам и пространственным распределением;
– стереоформация, образованная селективной коннексией носителей нескомпенсированных, частично нескомпенсированных и временно скомпенсированных электрических зарядов с их потенциальными, потоковыми и полевыми характеристикам и пространственным распределением, которые имеют пекулиарную структуру, обусловленную их конституцией, в том числе хиральной, конфигурацией, конформацией.
Селективная самосборка молекул в супрамолекулярное соединение определённой стереоформации предстаёт предшественником самодействия, аутоактантности, сциенции.
Супрамолекулярная система, приобретшая способность к созданию копии одного из своих компонентов становится протоорганоидом.
В соответствии с теорией кодофлексии эволюционное возникновение первичного биотранскодинга могло происходить следующим образом:
1. Последовательное абиогенное образование мономеров, олигомеров, полимеров, в том числе рацемической смеси полимеров.
2. Воздействие фотонов отражённого поляризованного электромагнитного излучения на рацемическую смесь полимеров с достижением хиральной чистоты.
3. Аутоактантное преобразование полимера с энантиомерными субчастицами с возникновением его копии.
Протоорганоид является первично транскодирующей супрамолекулярной системой с компонентами, отдельные частицы которых обладают хиральной чистотой.
В состав протосциенции входят следующие вещественно-энергетические знаки протоорганоидов:
– нескомпенсированные, частично нескомпенсированные и временно скомпенсированные электрические заряды, их потенциальные, потоковые и полевые характеристики;
– хиральная конституция, конфигурация, конформация носителей нескомпенсированных, частично нескомпенсированных и временно скомпенсированных электрических зарядов с их потенциальными, потоковыми и полевыми характеристикам;
– пекулиарная структура, обусловленная хиральной конституцией, конфигурацией, конформацией носителей нескомпенсированных, частично нескомпенсированных и временно скомпенсированных электрических зарядов с их потенциальными, потоковыми и полевыми характеристикам и пространственным распределением;
– стереоформация, образованная селективной коннексией носителей нескомпенсированных, частично нескомпенсированных и временно скомпенсированных электрических зарядов с их потенциальными, потоковыми и полевыми характеристикам и пространственным распределением, которые имеют пекулиарную структуру, обусловленную их хиральной конституцией, конфигурацией, конформацией.
Совокупность вещественно-энергетических знаков протоорганоидов, предстающая стереоформацией, образованной селективной коннексией носителей нескомпенсированных, частично нескомпенсированных и временно скомпенсированных электрических зарядов с их пространственным распределением, которые имеют пекулиарную структуру, обусловленную их хиральной конституцией, конфигурацией, конформацией, является энграммной протосциенцией.
Текущая реализация потенциальных, потоковых и полевых характеристик энграммной протосциенции является куррентной протосциенцией.
Энграммная протосциенция, являющаяся транскодирующей, и куррентная протосциенция, исполняющая энграммную, предстают протосциенцией протоорганоида.
Первичный биотранскодинг осуществляют, в частности, рибозимы вироидов. Рибозим – аббревиатура от слов «рибонуклеиновая кислота (РНК)» и «энзим85».
РНК – полимер, в котором каждое звено называется нуклеотидом. Каждый нуклеотид состоит из азотистого основания, сахара рибозы и фосфатной группы. К азотистым основаниям относят аденин, гуанин, цитозин, урацил. Рибоза – моносахарид из группы пентоз в форме правовращающей β-рибофуранозы. Фосфатная группа – остаток фосфорной кислоты (H3PO4). Четыре азотистых основания могут располагаться вдоль цепи мономеров в самой разной последовательности. Энзим представляет собой ускоритель, катализатор, коннексных преобразований.
Вироиды86 – лишенные оболочки небольшие молекулы кольцевой одноцепочечной РНК длиной в несколько сотен нуклеотидов. Рибозим как компонент вироида обладает способностью к первичному биотранскодингу, т.е. переносу вещественно-энергетических знаков сциенции с РНК на её копию при репликации87.
Сциенция протоорганоида синергирует квазисциенцию супрамолекулярных соединений, которая совмещает в себе антесциенцию органических полимеров.
Гипотетическая эволюционная стадия перехода от абиогенеза к биогенезу именуется «миром РНК». В соответствии с теорией кодофлексии репликация в «мире РНК», т.е. перенос вещественно-энергетических знаков сциенции с оригинала на копию, происходил вследствие воздействия высокоэнергетических фотонов поляризованной электромагнитной энергии на супрамолекулярную систему с компонентами, отдельные субмолекулярные частицы которых обладали хиральной чистотой.
Энергия фотонов поляризованного электромагнитного излучения, поглощаемая хиральными субмолекулярными частицами, придавала им кинетическую активность, которая в сочетании со всей совокупностью вещественно-энергетических знаков сциенции и с участием абиотических компонентов внешней среды супрамолекулярной системы вызывала репликацию.
Дарвиновская эволюция в «мире РНК» совершается через наследственность, изменчивость, отбор, но с преобладающим развитием и под влиянием сциенции, и приводит к образованию более сложных супрамолекулярных систем, таких как псевдоциты88, затем квазициты89.
Сциенция как совокупность биотических транскодируемых вещественно-энергетических знаков, знаков биотранскодинга, способствует организованности псевдоцита, затем квазицита и далее одноклеточного организма.
Псевдоцит предстаёт вирионом, предназначенным для сохранения и транскодирования своих органоидов, прежде всего нуклеинового.
Вирион на стадии «мира РНК» существовал в жидкой фазе, а на стадии биогенеза существует вне клеток в кристаллическом состоянии или в жидкой фазе, внутри клеток как вирус.
Одним из простейших вирионов является вирион риновируса90. Риновирус – безоболочечный РНК-содержащий вирус с размером до 30 нм в диаметре, покрытый капсидом91 из 4 разновидностей белка (VP1, VP2, VP3, VP4) с количеством белковых единиц в каждой разновидности равном 60.
Рибонуклеиновая кислота вириона риновируса представляет собой положительно полярную однонитевую РНК, содержащую 4209 оснований с молекулярная масса 2,5106 и кодирующей областью размером 2178 аминокислотных остатков. На её 5-конце имеется ковалентно связанный полипептид Jpg состоящий из 22 аминокислотных остатков, и на 3-конце – полипоследовательность из 35 оснований.
Системнологическое описание вириона риновируса представлено в таблице 2.
Таблица 2. Системнологическое описание псевдоцита
Сциенция вириона риновируса в соответствии с данным описанием предстаёт совокупностями вещественно-энергетических знаков белков VP1, VP2, VP3, VP4, полипептида VPg, полипоследовательности из адениновых оснований. Данная сциенция синергирует сциенцию протоорганоидов, описанную ранее. Дополнительной сциенцией вириона являются вещественно-энергетические знаки генов псевдоцита. Ген псевдоцита представляет собой обособленное в целях транскодирования сочетание нуклеотидов РНК.
Аутоактантность вириона выражается перманентным сциентным взаимодействием РНК и белков, обеспечивающим его стабильное существование. Аутоактантность вируса проявляется при репликации после эндоцитоза, сопровождающейся транскодированием.
Эволюция псевдоцитов с преобладающим развитием и под влиянием сциенции приводит к образованию квазицитов. Квазицит предстаёт сложным вирионом, например, вирионом герпеса92.
Вирион герпесвируса имеет неправильную сферическую форму диаметром 120–200 нм и состоит из 4 компонентов:
– двухцепочечной ДНК, ассоциированной с белками;
– нуклеокапсида диаметром 100–110 нм в форме икосаэдра93;
– белкового тегумента94;
– двухслойной липидной мембраны с белковыми выступами.
Сциенция вириона герпесвируса предстаёт совокупностями вещественно-энергетических знаков липид-белкового комплекса, белков. Дополнительной сциенцией вириона герпесвируса являются вещественно-энергетические знаки генов квазицита. Гены квазицита представляют собой обособленные в целях транскодирования сочетания нуклеотидов ДНК или РНК. Аутоактантность вириона выражается перманентным сциентным взаимодействием ДНК, РНК и белков, обеспечивающим его стабильное существование. Аутоактантность вируса проявляется при репликации после эндоцитоза, сопровождающейся переходом от одной совокупности вещественно-энергетических знаков к другой, т.е. транскодированием.
Организм филогенетического95 человека на взрослой стадии онтогенеза96 состоит из 1013 клеток, которые подразделяются более чем на 230 типов c разными структурой и функциями.
Клетки по морфофункциональным признакам тканей, в состав которыx они входят, подразделяются на 4 группы:
1) эпителиальные клетки, выполняющие барьерные функции;
2) клетки тканей внутренней среды, включая кровь, лимфу97, соединительные ткани и др., осуществляющие гомеостаз, трофическую, защитную, опорную и иную функции;
3) клетки мышечных тканей, обеспечивающие подвижность организма и его составляющих;
4) клетки нейральных тканей, осуществляющие сциентные функции.
Клетки первых трёх групп сопоставимы по общей организации, по структуре и функциям основных компонентов, но их сциентные функции ограничены. Системнологическое описание интерфазной одноядерной клетки обобщённого типа антропного организма представлено в таблице 3.