Внутренние органы кошек мало чем отличаются от таковых других млекопитающих.
Внутри грудной клетки, за грудной костью расположен полый мышечный орган – сердце. Это основной орган системы кровообращения. Вес сердца приблизительно составляет 0,6 % от веса кошки.
Дыхательную систему представляют нос, носоглотка, гортань, трахея, бронхи и парный орган, состоящий из правой и левой долей – легких, находящиеся в грудной клетке.
Частота дыхания кошек составляет 40 вдохов в минуту, но при возбуждении или повышении температуры окружающей среды кошка дышит чаще и открытым ртом. Такое дыхание способствует регуляции теплообмена и препятствует перегреву питомца. Пищеварительная система кошки состоит, как и у других млекопитающих, из ротовой полости, глотки, пищевода, желудка, тонкого и толстого отделов кишечника. Важную функцию при переработке пищи выполняют поджелудочная железа, двенадцатиперстная кишка и желчный пузырь. Под действием ферментов, имеющихся в слюне, пища начинает расщепляться уже при пережевывании в ротовой полости.